脑血栓急性期6小时之内，尤其是3-4.5小时之内，可以给予静脉溶栓治疗，这是目前最积极有效的治疗方法。静脉溶栓药物目前应用的有阿替普酶、尿激酶，如果错过了溶栓治疗时间窗，或者不适合静脉溶栓和动脉取栓的患者，应该积极给予抗血小板聚集的治疗。抗血小板药物，口服的有氯吡格雷片和阿司匹林肠溶片，静脉可以给予奥扎格雷钠注射液应用。
脑血栓急性期治疗可以给予尤瑞克林注射液、丁苯酞注射液，以改善侧枝循环，保护脑线粒体，促进神经功能恢复。另外急性期给予依达拉奉注射液，对清除氧自由基，脑保护，改善神经功能有一定作用。祖国的传统医药，如血栓通注射液、丹红注射液、疏血通注射液等等，有活血化瘀、改善脑部供血的作用，对促进神经功能改善也有一定作用。
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